秋、冬季黄渤海刺参养殖池塘细菌群落16S rDNA多样性研究

摘要

为研究黄海和渤海地区刺参养殖池塘海水和沉积物的细菌群落结构特点，以秋、冬季黄海和渤海代表性刺参养殖池塘海水和沉积物基因组DNA为模板，以细菌16S rDNA通用引物进行PCR扩增，构建16S rDNA文库并进行分析。结果表明，海水和沉积物中主要包括11个门类的细菌:变形菌门(Proteobacteria )(a-、β-、γ-、δ-和ε-亚纲)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、蓝细菌门(Cyanobacteria )、放线菌门(Actinobacte-ria)、酸杆菌门(Acidobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes) ,疣微菌门(Verrucomicrobia)、绿弯菌门(Chloroflexi )、硝化螺旋菌门(Nitrospira)、浮霉菌门(Planctomycetales )、梭杆菌门(Fuso-bacteria )，此外还存在部分未被认知的序列。黄海和渤海刺参养殖池塘海水和沉积物中优势类群均为变形菌，除渤海刺参养殖池塘秋、冬两季沉积物中菌群结构差异较大外，养殖池塘海水和沉积物中菌群结构在这两季中均差别不大。另外，在渤海刺参养殖池塘秋季沉积物中发现条件致病菌-Vibrio harveyi。本研究对了解黄渤海刺参养殖池塘细菌结构组成及进行刺参疾病的防御有重要意义。