猪繁殖与呼吸综合征病毒四川分离株ORF5基因的克隆及序列分析

摘要

本研究根据genbank中猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)VR-2332株的ORF5基因序列设计并合成了1对引物,对2株PRRSV四川分离株(SC1和SC2)进行RT-PCR扩增出了1条包括完整ORF5基因的739bp的cDNA片段.将该扩增片段经T-A连接插入pGEM-Teasy载体中,用重组质粒转化大肠杆菌DH5a,获得重组质粒转化菌.对重组质粒进行酶切鉴定,证明插入的cDNA片段与RT-PCR扩增的cDNA片段大小相符.同时对此cDNA片段进行全序列测定,并与美洲代表株VR-2332株及欧洲代表株LV做了比较.结果表明,2株四川分离株ORF5基因序列与VR-2332株的十分相似,其核苷酸同源性达到98-99﹪,氨基酸同源性为99﹪,而与LV株,则相差甚远,其核苷酸及氨基酸同源性分别为57﹪和54﹪.本研究为四川地区PRRS的诊断和防制提供了依据.