与苹果Co基因紧密连锁的RAPD标记的筛选及其SCAR标记转换

摘要

以短枝富士(Spur Fuji)×舞姿(Telamon)的105株F<,1>群体为试材,利用RAPD技术,结合集群分类分析法(BSA)进行了苹果柱型基因(Co)分子标记的研究.通过对300条随机引物的筛选,获得一个与Co基因紧密连锁的RAPD标记S1142<,682>,连锁距离为2.86cM.对该标记片段进行序列测定,然后根据序列特点设计了4条特异引物(其中正向引物与反向引物各两条).PCR结果显示,这4条引物的4种组合都可以扩增出柱型性状的特征带.选其中之一进行群体上的分析,结果表明该SCAR标记特征带与柱型性状的共分离行为与原RAPD标记表现一致.可见,此组合的引物可以作为该SCAR标记的特异引物.通过对S1142<,682>标记片段序列分析发现,在+45~+251区域含有一个可编码68个氨基酸残基的ORF.