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基于构象空间退火算法的蛋白质结构预测

摘要

对蛋白质结构从头预测方法中联合残基力场及其在该框架下的构象空间退火算法进行了系统的介绍和分析,由对CASP3中的7个蛋白质的预测的结果显示:α碳原子的RMSD在4-7A之间,改进的构象空间退火算法准确地预测了既包含α螺旋又包含β折叠的蛋白质1IGD的结构,克服了传统预测方法只能预测α螺旋结构的缺点,最后指出将构象空间退火算法与神经网络算法相结合,发展更加高效的方法.

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