定位、分离和鉴别影响猪脂肪沉积性状的硬脂酰辅酶A去饱和酶(SCD)基因

摘要

猪硬脂酰辅酶A去饱和酶(SCD)是调控脂肪代谢的酸.本文采用荧光原位杂交(FISH)及辐射杂种细胞克隆板(IMpRHpanel)扫描技术,首次将猪SCD基因精确定位于SSC14q27.通过筛选猪PAC文库,采用重叠群构建和亚克隆测序技术,获得了20985bp的全长DNA序列(AY487830),并通过5'RACE和3'RACE技术,克隆了全长cDNA序列(5134bp,AY487829),揭示出猪SCD基因由6个外显子和5个内含子组成,含16个重复元件.转录单元长16186bp,1080bp开放阅读框架编码359氨基酸组成的多肽,与其他哺乳动物SCD酶有很高的同源性.5侧翼序列存在1个CpG岛和多个与脂肪代谢相关的调控元件,3非翻译区长达3848bp,内含3个潜在的与mRNA稳定性相关的结构元件.采用RT-PCR技术,揭示出猪SCD基因广泛表达于各类组织.采用池DNA比较测序技术,鉴别了24个多态标记(22个SNP和2个插入多态),其中SNPC-233T和SNPC641T在中西方猪种中呈极端偏离的基因频率分布,SNPC641T在白色杜洛克×二花脸猪资源家系F2群体中与第6～7肋骨背膘厚、最后肋骨背膘厚及四点均膘厚等脂肪沉积性状呈显著相关性(P＜0.03),与板油重、花油重、腹脂重等性状关联性不明显.