应用16S rDNA方法分析湖泊沉积物中微生物种群的多样性

摘要

本文应用聚合酶链式反应(PCR)技术,分别从太湖不同深度底泥中直接提取微生物的总DNA,用两套不同细菌通用引物进行扩增,得到包括V3～V5和V3高变区的16S rDNA片段,经变性剃度凝胶电泳(DGGE)分析,结果表明:底泥中存在丰富的的微生物多样性,且不同深度微生物多样性有差异.选择对16S r DNA基因(V3区)的DGGE图谱5个主要条带回收、扩增和测序分析,结果显示:每个条带是由序列不同的片段组成,得到的3个序列与GeneBank中已登录的目前尚无法分离培养的未知名的菌种之间细菌细菌种群的同源性≥95％,2个与已登录的目前尚无法分离培养的未知名的菌种之间细菌种群的同源性为93％.最后对两套引物扩增的结果提出几点看法.