氢氘交换质谱研究反铂类抗肿瘤化合物损伤DNA与蛋白质的相互作用

摘要

反铂类抗肿瘤化合物trans-PtTz与含有GTG序列的DNA形成，3—链内交联复合物。前期研究结果表明，细胞核RNA聚合酶B转录辅助因子PC4能够特异性的识别该，3—链内交联DNA复合物，但其相互识别的分子基础还不清楚。本工作采用氢氖交换质谱和分子对接联用的分析方法，研究了trans-PtTz损伤双链DNA与PC4蛋白的非共价相互作用。氢氖交换质谱分析和分子对接研究具有非常好的互补性，它们的联用能够有效的用于定位DNA或药物损伤与蛋白质的相互作用区域，鉴定DNA在蛋白质上的结合位点，适合于研究配体与蛋白质的相互作用。