广西黄鸡β-防御素Gal-1～Gal-13基因的克隆、序列分析与组织分布

摘要

用所设计的引物,采用RT-PCR技术特异性地扩增到广西黄鸡β-防御素基因Gallinacin-1(简称Gal-1)～Gallinacin-13(简称Gal-13)基因共13个基因编码区全长片段.通过克隆、测序获得13个基因的cDNA核苷酸序列,并提交到GeneBank中获得广西黄鸡β-防御素Gal-1～Gal-13基因的注册号为:DQ858297-DQ858310.比较分析广西黄鸡13种β-防御素Gal-1～Gal-13基因分别与GenBank中注册的防御素基因氨基酸序列的同源性,其氨基酸的同源性均在95.4％～100％之间.利用DNAStar软件对本试验所测得的13种广西黄鸡防御素基因进行系统发育树分析,结果Gal-l与Gal-5、12、2在同一分支上,Gal-6、7、9、8在同一分支上,Gal-10、11、4在同一分支,Gal-13独在一分支上.同样用RT-PCR方法分析了广西黄鸡β-防御素Gal-1～Gal-13基因在不同组织中的分布,结果发现:Gal-1/2/4/5/6/7/10的表达分布非常广泛,Gal-3/8/9/11/12/13的分布少.