PCV2河北株的分离鉴定及其全基因组序列分析

摘要

从河北保定和衡水两个规模化猪场首次分离鉴定了两株PCV2,分别命名为BD1A和HSH1,并对其进行了全基因组序列与系统进化分析。BD1A和HSH1的基因组均由1767 bp组成,BD1A包括11个开放阅读框(ORFs),HSH1包括12个ORFs,其中ORF2基因编码的Cap蛋白可能存在9个抗原表位；两毒株间及其与国内外不同PCV2毒株之间的核苷酸序列的同源性分别为98.0％和94.7％～99.3％。病毒基因组系统进化分析结果表明,BD1A与HSH1的亲缘关系较近,均位于PCV2第1组中的1A簇,但BD1A与福建分离株putian0401的亲缘关系更近,而HSH1与北京分离株BJ-HB、巴西分离株BRA1、荷兰分离株NL_PMWS_2及中国山东分离毒株SD2的亲缘关系更近,说明河北流行的PCV2不同毒株在进化上存在较明显差异,具有多样性特点,提示它们可能在外界环境的选择压力下,由同一来源的毒株突变或由不同来源的PCV2毒株重组进化而来。