奶牛pIgR基因多态性及其对牛奶中IgA和IgM含量的影响

摘要

从NCBI上的Map Viewer数据库下载牛pIgR基因的启动子区域的序列(NW_174143)，长度为3.2Kb，设计4对引物进行PCR扩增，通过对25头牛的PCR产物直接测序发现并确定SNP位点，并用SNP Stream标签微列阵基因分型系统对189头牛进行基因分型，将其与牛奶中IgA和IgM的含量进行相关分析。结果表明，在基因-3128、-3072、-2834、-2348和-515位发现了5个SNP位点，其中SNP1和SNP2为A/G突变，SNP3、SNP4和SNP5为T/C突变，该群体的5个位点的基因型分布处于非Hardy-Weinberg平衡状态。方差分析结果表明，SNP1对牛奶IgM含量有极显着的影响(P<0.01)，而单倍型组合对牛奶IgA和IgM的含量无显著的影响(P>0.05);多重比较分析表明，SNP1位点的基因型AA个体与AB个体的牛奶IgM含量的最小二乘均数差异极显著(P<0.01);SNP2的基因型AB个体和BB个体的牛奶IgM含量的最小二乘均数差异显著(P<0.05);SNP3、SNP4和SNP5的不同基因型对牛奶IgA含量的最小二乘均数分别达到了显著(P<0.05)水平;单倍型组合为H1H1、H1H5和H3H6的牛奶IgA含量的最小二乘均数显著(P<0.05)高于H4H4和H5H6单倍型组合，其它单倍型个体之间差异均不显著(P>0.05)。因此，我们得出牛pIgR基因的多态性影响牛奶中IgA和IgM的含量，这为进一步研究牛奶中IgA和IgM分泌转运机理提供了一定的理论依据。