BC1设计下标记密度对QTL定位精确性的影响

摘要

本文通过计算机模拟分析BC1 设计中标记密度(标记间隔5cM、10cM、20cM、 50cM)对QTL 定位精确性的影响,以均方误(MSE)为衡量指标。结果表明,当遗传图谱上相邻标记间的图距在5cM 以上时,提高标记密度,对于提高QTL 定位的准确性和精确性具有积极的效应,但当标记密度达到某一程度(相邻标记间图距为2cM)时,由于方法本身的局限,继续增加标记密度,对标记-QTL 连锁分析法定位QTL 的效果则没有实际意义。标记密度对检验统计量LOD 值的影响则不明显。

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