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利用MetaMap基于科研项目分析学科领域研究热点的尝试

摘要

目的 探索基于科研项目信息分析学科领域研究热点的可行性.方法以原发性高血压的发病基因机制为切入点t检索美国国立卫生研究院(NIH)的科研项目信息库(CzlsP).以“essential hypertension”为检索词查询2006年的资助课题,并利用 Metamap对课题的名称及摘要字段进行自然语言处理.应用自编软件提取语义类型为“Gene or Genome”、“Enzyme”、“Receptor”、“Nucleic Acid,Nucleoside,orNucIeotide”、“Amino Acid,Peptide,Or Protein”,出现频次>=3的基因类概念.根据内容对这些基因类概念进行分析归类.结果2006年NIH共资助原发性高血压相关研究项目73项.经过MetaMap的处理后的基因类概念可分为七类,分别是肾素一血管紧张素质相关基因、C蛋白/信号传导系统相关基因、血管内皮合成相关基因、交感神经一儿茶酚胺系统相关基因、心肌肥厚相关基因、中枢神经系统相关基因、胰岛素相关基因.结论 根据学科近年的科研立项信息分析学科域研究热点具有可行性,可与常用文献分析方法互为补充.Metamap是自然语言处理的较好工具,但亦有一定局限性,很多基因类概念提取时需人工筛选.

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