利用EST-SSR基因分型研究分子标记与茶树表型性状的关联性

摘要

通过EST-SSR标记对112份茶树资源材料进行基因分型,开展了分子标记与新梢一芽二叶长(BL)、一芽二叶百芽重(BW)、叶长长度(LL)、叶片宽度(LW)、咖啡碱含量(CAF)、氨基酸含量(AA)和茶多酚含量(TP)共7个茶树表型性状关联的初步分析。结果表明,在不考虑位点间的连锁不平衡(LD)和供试群体的结构(SA)时,利用ANOVA方法可检测到三个EST-SSR位点185、121和153与五个表型性状显著相关,其中标记185同时与4个表型性状BL、BW、LL和LW显著相关,标记121同时与3个表型性状BW、LL和LW显著相关,而153仅与AA显著相关.但在考虑位点间的连锁不平衡和供试群体结构的情况下,通过回归分析仅鉴定出2个EST-SSR标记153和84与两个表型性状显著关联,其中标记153与性状LL显著关联,对表型变异的解释率为0.07,而标记84与性状TP显著关联,对表型的解释率为0.35.两种检测方法中,仅有一个标记153被同时检出,但与之关联的性状却存在差异。在不考虑供试样本群体结构的情况下,亚群的混合使整个群体所估计的LD强度增强,可能导致多态性位点与性状的相关性并非由功能性等位基因引起,从而可能提供了假阳性结果。因此在关联分析前有必要对群体结构进行分析和调节.