猪Small Nidovirus复制过程调控的分子解剖

摘要

猪繁殖与呼吸综合征病毒(Porcine Reproductive and Respiratory Syndromevirus，PRRSV)的基因组5'UTR，3' UTR以及最主要的结构蛋白-核衣壳蛋白(Nucleocapsid protein)是调控病毒的感染性、复制、转录、翻译以及病毒粒子的包装的重要元件，但机制不明。本研究发现病毒一级序列同源性低于70％，但二级结构相似性较高的基因I型的PRRSV 5' UTR和3` UTR均能替代II型PRRSV的相应序列;Mfold结构预测发现对5' UTR含有5个茎环结构(Stem-Loop Structure，SL)，定点突变结果表明5'SL2是病毒的转录所必须，并确定了其茎(Stem)部分最多能够承受的3个碱基对的缺失。以上结果首次揭示二级RNA结构对PRRSV复制调控起着较之一级序列更加重要的作用。