甲状腺癌患者血液DNA甲基化标志物的研究

摘要

[目的]探讨甲状腺癌患者血液中DNA甲基化情况,筛选出甲状腺癌特异的甲基化标志物。[方法]收集上海地区甲状腺癌患者血液14例,正常对照血液10例,分别提取全血基因组DNA,利用Illumina 27K甲基化芯片筛选样本,得到甲状腺癌血液DNA甲基化谱,并进行生物信息学分析和统计学处理。[结果]采用Fisher、Pearson和Wilcoxon检验进行病例组和对照组之间位点的甲基化差异化分析,统计学显著性筛选阈值选择P≤5E-4,29个基因在病例组中显著高表达(高甲基化);11个基因在病例组中低表达(低甲基化)。如果按照显著性阈值P≤1E-4,则筛选出的差异甲基化基因(位点)总计8个,其中7个基因在病例组中显著高表达(高甲基化);1个基因在病例组中显著低表达(低甲基化)。[结论]高甲基化基因可能是抑癌基因甲基化,是甲状腺癌的致病因素之一,可作为甲状腺癌血液诊断的分子标志物之一。