BST-2跨膜区和Vpu跨膜区结合模式的分子模拟研究

摘要

BST-2为新近发现的一种HIV-1宿主限制因子,可以有效抑制HIV-1病毒的释放,进而阻断病毒的复制。HIV-1编码的Vpu蛋白可以下调细胞表面的BST-2,保证病毒的正常释放。Vpu跨膜区与BST-2跨膜区的相互作用是Vpu对BST-2拮抗作用的关键,削弱这一相互作用可以有效的阻断Vpu介导的BST-2下调过程。因而,BST-2跨膜区和Vpu跨膜区相互作用面成为了颇具潜力的抗HIV-1靶点。在本论文中,我们采用分子模拟的方法构建了一个BST-2跨膜区和Vpu跨膜区的结合模型。该模型与文献报道中生物分析数据相一致。在此基础上,我们得到了相应的药效团模型。我们建立的模型对BST-2跨膜区和Vpu跨膜区相互作用有原子水平的理解,将有利于靶向BST-2和Vpu作用面的抗-HIV1的药物开发。